ان الأكثار من شرب النسكافية قد يؤثلر على الجهاز الهضمي وقد يؤدي الى قرحة المعدة.
اذا تم شرب النكافية بعد وجبات الطعام قد يتعارض ويؤثر على امتصاص معدن الحديد الموجود بالأكل.
المواد المنبهة وخاصة النسكافية ينصح بعدم تناولها باليل وذلك لتجنب مشكلة الأرق.
مادة الأكريلاميد مادة كيميائية ضارة تتشكل عند تحميص حبوب البن, توجد هذه المادة الكيميائية أيضًا بشكل شائع في مجموعة واسعة من الأطعمة والدخان والأدوات المنزلية ومنتجات العناية الشخصية, قد يحتوي النسكافية على ما يصل إلى ضعف كمية مادة الأكريلاميد الموجودة في القهوة الطازجة المحمصة يؤدي التعرض المفرط لمادة الأكريلاميد إلى تلف الجهاز العصبي وزيادة خطر الإصابة بالسرطان.