القولون العصبي هو مرض وظيفي غير عضوي ولا يوجد علاج محدد له ولكن ممكن إجراء بعض التغييرات في نمط الحياة وأخذ بعض الأدوية للتخفيف من الأعراض.
التغييرات في نمط الحياة تشمل التخفيف من القلق، النوم الكافي، الابتعاد عن الأطعمة التي تهيج القولون لديك.
كما ممكن استخدام أدوية للتخفيف من ألم البطن أو الغازات أو أدوية للإمساك أو الإسهال على حسب أعراض المريض.