رغم الفوائد الصحية المتعددة التي تحتوي عليها " الطحينية " , إلا أنه هنالك العديد من المضار بشأنها , بحيث تعتبر مصدر غني بالأحماض الدهنية خصوصاً "الأوميغا 6 " والذي يحتاجه الجسم بكميات معروفة , ولكن الإستهلاك المفرط لمصادر الأوميغا6 وقلة إستهلاك مصادر الأوميغا3 يؤدي إلى حدوث إلتهابات مزمنة في الجسم , وقد يتعرض بعض الأشخاص لردة فعل مناعية خصوصاً إتجاه بذور السمسم مما يؤدي إلى ظهور حساسية تتمثل بمضاعفات متعددة ومنها عدم القدرة على التنفس والحكة وإحمرار الجلد !