تختلف الأسباب من شخص لآخر ولكن من أبرزها التالي :
- العادات الغذائية السيئة , والتي تزداد مضاعفات القولون بتناولها وخصوصاً الأطعمة المنتجة للغازات مثل البصل والثوم والبقوليات والملفوف والمشروبات الغازية والحيب والأطعمة الحارة والتوابل .
- تعرض الأشخاص للتوتر والقلق والضغوطات والتي تؤدي إلى زيادة تهيج القولون .
- تغيرات هرمونية , مثل الدورة الشهرية .
-حساسية لبعض أنواع الأطعمة .
- إلتهابات معدية معوية .
- إستعمال المضادات الحيوية .
فرط نمو البكتيريا بالأمعاء الدقيقة .