يتم المحافظة على الفطرة من خلال التتشبُّت والتمسك بالأحكام الشرعية، كذلك من خلال مجابهة ومحاربة كافة أنواع الشبهات التي تحول بين المرء وفطرته.
أيضاً من خلال الحفاظ على الموروث الفكري والديني وعدم التأثر بالعقائد والأفكار الدخيلة.
ومن وسائل المحافظة على الفِطرة هو الحفاظ على النسيج الاجتماعي وكلاهما مرتبط بالآخر.