هضم الدهون يبدأ في الأمعاء الدقيقة بوجود إنزيم تفرزه البنكرياس وأملاح الصفراء في الكبد، فأملاح الصفراء تساعد على تكوين مستحلب وعلى معادلة حموضة الغذاء، والإنزيم الذي تفرزه البنكرياس يعمل على تحويل الدهون إلى جليسرول، وأحماض دهنية، ثلث الأحماض الدهنية فقط يتحول إلى جليسريدات ثنائية والباقي يخزن ككتل دهنية في الجسم و تتمّ عملية هضم الدهون بالأمعاء الدقيقة دون الحاجة إلى وجود الماء بعكس الكربوهيدرات والبروتينات التي يجب أن تمتزج بالماء لتهضم.