يتم هضم الدهون في الفم والمعدة والأمعاء الدقيقة، بفعل عدة إنزيمات أهمها اللايباز Lipase.
ويبقى هضم الدهون في الفم ضئيلاً مقارنة بالأعضاء الأخرى، ولكن يبرز دوره عند الأطفال الرضع.
أما في المعدة، فيساهم إنزيم اللايباز هناك في هضم قرابة ربع الدهون الداخلة للجهاز الهضمي.
أما أهم خطوات هضم الدهون فتتم في الاثني عشر، وهو أول أجزاء الأمعاء الدقيقة، إذ تختلط هناك بإفرازات المرارة، مثل الحمض الصفراوي، وبإفرازات البنكرياس، فيتم هضمها بشكل كامل.