يعتبر السونار المهبلي آمن خلال فترة الحمل وليس له أي مضاعفات جانبية على الجنين.
اثناء إجراء الفحص بالسونار المهبلي قد تشعر الحامل ببعض من الضغط أو عدم الارتياح وذلك امر طبيعي ولا يستدعي القلق.
هناك حالات معينة يجب فحصها من خلال السونار المهبلي ولا يوجد أي ضرر من ذلك.