من اهم امراض المناعة الذاتية :
- الذئبة الحمراء.
- السكري.من النوع الاول : بحيث تقوم خلايا الجهاز المناعي بماهجمة خلايا بيتا في البنكرياس و هي الخلايا المسؤولة عن تصنيع الانسولين .
- الروماتيزم او التهاب المفاصل الروماتيزمي تقوم بها خلايا الجهاز المناعي بمهاجمة مفاصل الجسم المختلففة .
- الصدفية.
- مرض هاشيموتو : هو مرض يؤدي إلى مهاجمة خلايا الغدة الدرقية مما يتسبب بقصور في عمل الغدة الدرقية
- تليّف الأنسجة.
- التصلب اللويحي.
- مرض كرون
- مرض القولون التقرحي
*** والجدير بالذكر ان امراض المناعة الذاتية تحدث نتيجة وجود خلل في الجهاز المناعي مسببة قيام خلاياه بمهاجمة اعضاء الجسم المختلفة .