لا يجوز استخدام حبوب منع الحمل أثناء فترة الحمل.
في حال تم أخذ الحبوب في بداية الحمل فلا يؤدي ذلك إلى عيوب خلقية لدى الجنين.
ولكن أشارت بعض الدراسات بأن أخذ الحبوب في تزامن مع وقت حدوث الإخصاب قد يزيد فرصة بعض المضاعفات مثل الولادة المبكرة، ولادة طفل بوزن قليل أو عيوب في الجهاز البولي.
كما ان الحمل أثناء استخدام مانع الحمل الهرموني (بروجيسترون) قد يزيد احتمالية الحمل خارج الرحم.