رغم تعدد فوائده إلا أنه يملك العديد من المضار التي لا ننتبه لها :
- من الممكن أن يسبب إستهلاك السمسم حساسية لبعض الأشخاص .
- يسبب الطفح والإلتهاب الجلدي , الغثيان والقيء ووجع البطن .
-يعمل على زيادة الوزن وتراكم الدهون الخطرة .
- من الممكن أن تنعكس الآية ويسبب مشاكل في الجهاز الهضمي في حالة الحساسية .- قد يسبب مشاكل في الكلى .