الأعراض الجانبية الأكثر شيوعًا للأدوية التي يتم استخدامها كمضادات للحموضة و بالتالي تستخدم في علاج الحموضة و حرقة المعدة الناتجة عنها و هي :
** إذا كانت تحتوي على هيدروكسيد الألمونيوم فإنها تسبب الإمساك ، و ترقق العظام ، كما أنها قد تتسبب في نزول مستويات الفوسفات في الدم
** مضدات الحموضة التي تحتوي على المغنسيوم تسبب الإسهال ، كما تسبب ارتفاعًا في مستوى المغنيسيوم في حال كان الشخص يعاني من قصور في وظائف الكلى
** مضادات الهيستامين : بعض الأنواع تسبب اضطرابات في القناة الهضمية
** مثبطات مضخات البروتونات تسبب سوء امتصاص فيتامين B-