تحدث مشكلة سوء الإمتصاص نتيجة رفض الجسم لامتصاص بعض العناصر الغذائية التي تشمل الكربوهيدرات و البروتينات و الفيتامينات و المعادن مثل الحديدو الزنك و غيرها.
و عادة يتم علاج سوء الإمتصاص بتعويض الجسم بكميات كبيرة من المواد الغذائية التي لا يتقبل الجسم امتصاصها، مثل اتباع أنظمة غذائية بشكل يومي تتضمن كافة أنواع الفيتامينات أو المعادن أو البروتينات أو الكربوهيدرات التي لا يمتصها الجسم، وذلك يتم تحديده عند فحص عينة من الدّم و تحديد المواد الناقصة فيها.
ومن الجدير بالذكر أن الحمضيات عامة و الليمون و البرتقال بشكل خاص يساعد على زيادة نسبة امتصاص العناصر الغذائية من الأطعمة، بحيث ينصح الذين يعانون من مشكلة سوء الامتصاص بأن يستخدمو الليمون في الأطعمة المختلفة، مثلاً أن يُعصر الليمون على السبانخ أو الأوراق الخضراء بالإضافة للسلطات و غيرها.
علاج المسبب لسوء الامتصاص مثلاً كسل الأمعاء يسبب مشكلة سوء الإمتصاص، و بالتالي يجب الاهتمام بمشكلة كسل الأمعاء و حلها بأكبر قدر ممكن ليتم حل مشكلة سوء الإمتصاص.