لسوء الهضم أو عسر الهضم أسباب عديدة من أهمها الأسباب التالية:
- القيام بتناول الأكل بسرعة بالإضافة لعدم مضغ الطعام بشكل جيد.
- أن يكون الشخص مصاب بمرض القلس المعوي المريئي وهو التهاب يصيب القسم السفلي من المريء.
- تناول بعض الأدوية مثل مضادات الألم والمسكنات من النوع غير السترويدي.