يتم توزيع الدواء بالمستتشفيات، بطرق مختلفة يتم اعتمادها ضمن معايير معينة، والهدف منها تسهيل مهمة الصيدلي بالعثور على الدواء، وتوفير الوقت عليه، ولتتيح وقت أكير للمشورة الطبية، ومن طرق توزيعها، توزيع الأدوية بالطريقة الأبجدية، وحسب الحروف، أو توزيعها حسب طريقة عملها على الأجهزة المختلفة بالجسم، مثل أدوية الباطني، أدوية الجهاز التنفسي، أدوية الجهاز الهضمي، قطرات ومراهم العين والأذن، والأنف، كما يتم أحينًا تخصيص صيدلية بالمستشفى فقط للأدوية التي تعطى عن طريق الحقن.