هناك العديد من الفروع والمجالات المتنوعة الخاصة بالهندسة الطبية وهي :
أولا :هندسة صناعة الأجهزة الطبية وصيانتها .
ثانيا:هندسة صناعة الأطراف الصناعية.
ثالثا:هندسة الكيمياء الحيوية .
رابعا: هندسة الصحة البيئية .
خامسا: هندسة البصريات الطبية والحيوية .
سادسا: هندسة المواد الحيوية .