الكبتاجون يعتبر من محفزات وظائف الجهاز االعصبي المركزي ، لكن آثاره الجانبية خطيرة على صعيد صحة الأوعية الدموية في الدماغ ، حيث تسبب جرعاته العالية وعلى فترات طويلة السكتات الدماغية والنوبات الصرعية ، كما أنه يسبب الأمراض النفسية مثل : الإكتئاب والهلوسات بأنواعها ، ويسبب أيضًا فقدان التوازن والسيطرة على الحركة ، وارتفاع ضغط الدم المزمن ، مع تسارع شديد في معدل نبضات القلب ، كما يسبب اضطرابات النطق والكلام ، وتورم الأطراف السفلية والكاحل .