تنجم اضرار المضادات الحيوية من سوء استخدامها او استخدامها بكثرة, كالافراط في تناول المضادات الحيوية يعمل على مقاومة البكتيريل للدواء, اما في حالة الاصابة بالامراض الفيروسية ياخذ المصاب مضادا حيويا "كالانفلونزا مثلا " حيث ان المضادات الحيوية لاتعطى في الاصابات الفيروسية ولاتحدث اي تاثير على الفيروسات. بالاضافة الى الضرر الذي يحدث نتيجة لعدم التزام المريض بالجرعات العلاجية والكمية الموصوفة والمكتوبة له وغيرها الكثير من العادات الخاطئة والتي ينجم عنها:
- تطور المرض بسبب مقاومة البكتيريا للمضادات الحيوية واخذ فترة زمنية اكبر للشفاء وذات تكلفة أعلى.
- قد تحدث مضاعفات للمرض تؤدي الى الوفاة
- قد تحدث اضطرابات في القناة الهضمية اسهال او امساك او آلاما معدية او حموضة
- الاضطرابات النفسية القلق التوتر والاكتئاب.
- واهم ضرر كما ذكرت سابقا بان له تاثير على الجهاز المناعي سلبا اذا ما تم استخدامها بشكل خاطئ
- بعض المضادات الحيوية قد تسبب سوء استخدامها الى تكسر في كريات الدم او التهابات معوية او السمنة او طفح جلدي ...