هناك الكثير من الخيارات بالنسبة للمهندسين الطبيين، فهو تخصص يجمع من أكثر من مجال، منها العمل في المختبرات الطبي، والمراكز العلاجية والمستشفيات، مراكز التصوير بالأشعة ومراكز الأجهزة الطبية والمعدات فهم يشرفون على إصلاح الأجهزة وتركيبها، وقد تكون وظيفتهم تسويقية ببيع هذه الأجهزة إلى الأماكن الطبية المتخصصة بذلك
بالإضافة إلى العمل على تطوير هذه الآلات وإجراء الدراسات والأبحاث فيما يخصها