الأمراض التي يكون سببها خلل في الجهاز المناعي ، تحدث عندما تعجز المناعة بالتأقلم مع بعض الخلايا في أحد أعضاء ومكونات الجسم .
ومن هذه الأمراض الأمراض التي تصيب المفاصل مثل الروماتزم ،وأمراض الجلد مثل جفاف تيبس وجفاف الجلد، والمرض النادر الذئبة الحمراء ،حيث أنه يصيب عدد قليل من الناس داخل المجتمع الكبير ، وأمراض تصيب المسالك البولية والكلي .