عادة ما يتم علاج تكيس المبايض من خلال حبوب منع الحمل التي تحتوي على البروجيسترون والاستروجين و تعمل هذه الحبوب على اعادة انتظام الدورة الشهرية
او من خلال مضادات الاندروجين يعالج زيادة الشعر الناتجة عن الخلل في الهرمونات
و كذلك الميتفورمين الذي يعيد الاباضة
و هذا العلاج يتم اعتماده بعد التشحيص و الفحص من قبل الطبيب الاخصائي
و ذلك حسب الاعراض المرافقة للتكيس