المشكلة والإشكالية يحتاجان الى اجابات دقيقة, غير ان الأشكالية هي اعم من المشكلة وتشملها, وبينما يمكن انهاء المشكلة في البحث العلمي من خلال جواب واحد او بحث واحد, تبقى الإشكالية مفتوحة, وتحتمل عدة اجوبة, ومثال على ذلك البحوث العلمية التي قدمها العلماء في مطلع القرن الماضي, حيث واجهوا اشكالية تتعلق بسلوك مكونات الذرة بطريقة مخالفة للفيزياء الكلاسيكية رغم حلهم كل المشاكل المتعلقة بالتجارب والمعادلات الرياضية المختصة, وقد بقيت الإشكالية قائمة حتى تم تطوير فيزياء الكم التي استطاعت الإجابة عن الأسئلة المختلفة حول سلوك مكونات الذرة.