يتغير لون الثوم الى اللون الاخضر بعد فرمه بسبب احتواؤه على انواع من الانزيمات ووجود عنصر الكبريت وبعض الاحماض الامينية ووج د بعض المعادن مثل النحاس
يكون مصدرها اما من حبة الثوم نفسها او من الماء الذي سقيت منه، فينتج عنه ظهور مركبات لونها اخضر او ازرق مثل كبريتات النحاس ويؤدي الى تغير لونها
وتعتمد سرعة تغير لونه على عدة عوامل منها طريقة تخزينه ودرجة الحراة ومده تخزينه بعد الحصاد، والرطوبة
ويعتبر تناول الثوم امن حتى عند تغير لونه ولا يشكل اي خطورة على الجسم