يتم معالجة الحيوان من مرض الاغشية المخاطية من خلال التطعيم اللازم والمناسب واللقاحات المناسبة للحاله من قبل الطبيب البيطري بعد ان يتم تشخيص الحالة المرضية وعن طريق المضادات الحيوية اللازمه ويجب الكشف المبكر عن المرض وتشخيص الحاله حتى تتجنب انتشار المرض والعدوى بين الحيوانات الاخرى وعند اصابة احد الحيوانات يجب عزلها عن الحيوانات السليمه وتنظيف المكان والحرص على نظافه الطعام والماء امام الحيوانات