يوجد العديد من المُضاعفات التي تخص الشفة الأرنبية حيث أنها بشكل عام بالعادة ما تؤثر على الشكل الجمالي الخارجي للإنسان كما أن الشخص الذي بالعادة ما يُعاني منها يُعاني منم صعوبة في التغذية، حيث يجدر الإشارة غلى كون الأطفتلا بالعادة لا يستطيعون الرضاعة في حالا تواجدها.
كما يجب التنوية أن كل من الغذاء والسوائل من المُمكن أن تدخل في الشق الموجود في سقف الحلق والذي بالعادة ما يمون مُصاحباً للشفة الأرنبية وهذا الأمر من شأنه أن يعمل على حدوث العديد من الإلتهابات للطفل، حيث يتم العمل على نصح والدة الطفل بالإهتمام بشكل كبير في نظافة كل من أنف وفم الطفل حتى لا يكون عرضة للإصابة بالإلتهابات والعديد من المشاكل الأخرى.