مخاطر الإنهضام الذاتي والمعروف بالتحلل الذاتي، وتوجد هذه الحالة في المعدة، مثلاً عندما تهضم العصارة المعدية جدار المعدة
تكمن الخطورة في التقرحات التي ممكن أن تحدث في الأنسجه وجدار المعدة، وقد تؤثر على الأنسجة المجاورة من الأمعاء الدقيقة.
بما معناه ان الخلايا التي تفرز لهضم أجزاء وأغذية تفيد الإنسان تقوم بهضم الخلايا السليمة من نفس العضو.
مثل خلايا الدم البيضاء كذلك التي تفرز في الجلد في حال تعرض الجلد للقطع او الجرح وتقوم بمحاربة البكتيرياىلكنها في بعض الحالات مثل الصدفية تقوم بمخاجمة الخلايا الجلدية وتعمل على احداث تلف في الجلد وظهور بقع حمراء عليها قشور بيضاء.