عند إنهاء درجة البكالوريوس في الطب البيطري يستطيع الدارس أن يلتحق ببرنامج الماجستير حيث تطرح الجامعات في الوطن العربية بعض التخصصات لعل أبرزها ما يلي:
- الرقابة الصحية على الأغذية.
- التلقيح الصناعي.
- أمراض الباطنة.
- التشريح.
- الأمراض المعدية
- الأمراض الفيروسية.
هذه هي التخصصات التي تطرحها بعض الجامعات العربية في برنامج الدراسات العليا المتعلقة بالطب البيطري.