تختلف اعراض مرض اختزان الغليكوجين حسب نوع مراه اختزان الغليكوجين حيث انك لن يؤثر على عضو معين فمثلا 01 وثلاثه و 4 و 6 تؤثر على الكبد والاعراض المرتبطه بها هي تضخم الكبد و انخفاض مستوى الجلوكوز في الدم ما يؤدي الى ظهور الاعراض المختلفه مثل الدوخه ودوار ولعيان والتعب والضعف العام والارهاق الشديد والاصابه بتشنجات والنوبات والتعرق والصداع والارتباك والتشويش في بعض الاحيان والدخول في غيبوبه في بعض الحالات
كمان انواع التي تؤثر على العضلات الهيكليه يؤدي الى ظهور الاعراض الخاصه بها مثل ضعف العضلات وتشنجاتها
وبشكل عام فان مرض اختزان الغليكوجين يؤدي الى بطء النمو والضعف العام سهوله النزف نقص المناعه و الاصابه بامراض الكلى والسمنه