يتم علاج مرض هاشيموتو من خلال الإجراءات العلاجية التالية:
- العلاج بالهرمون البديل عن هرمون الدرقية: يتسبب مرض هاشيموتو بقصور الغدة الدرقية أي عدم انتاجها ما يكفي من الهرمونات الضرورية للجسم وبالتالي فإنّه لعلاج مرض هاشيموتو لا بد من تناول الأدوية التي تحتوي على الهرمون الاصطناعي للدرقية وهو الليفوثيروكسين ومن الممكن ان تستدعي الحالة الاستمرار بالعلاج الدوائي طيلة الحياة.
- ولا بد من تحديد الجرعة الدوائية المناسبة في بداية الأمر وذلك بالفحص عن مستويات هرمون الغدة الدرقية، ومن ثم اختبار الدواء المناسب.
ويتأثر دواء الليفوثيروكسين بالعديد من العوامل كتناول بعض الأدوية الأخرى والمكملات ومنها:
*المكملات التي تحتوي على الحديد.
*الأدوية الخافضة لمستويات الكولسترول.
*مكملات الكالسيوم.
*بعض أنواع مضادات الحموضة.