تجرى مجموعة فحوصات مخبرية على الطعام في مختبرات الأحياء الدقيقة و ذلك للكشف عن مدى فاعلية الإنتاج و نظافة المنتج الغذائي وبعد اجراء سلسلة من التحاليل المخبرية على منتجات الغذاء يتم منحها شهادة المواصفات الغذائية ضمن شروط معينة و ذلك لمعرفة نسبة وجود البكتيريا بالمنتج الغذائي سواء كانت بكتيريا نافعة أو ضارة و يتم ذلك بأخذ عينة و مسحها و زراعتها على بيئة آغار مناسبة و مراقبة نمو البكتيريا و معاينتها بحال وجودها.
و يمكن اجراء فحص احيائي على اللحوم وخاصةً لحوم الأبقار لمعاينتها، لفرض وجود بيوض الديدان و الطفيليات و ذلك بأخذ عينة منها و معاينتها باستخدام الميكروسكوب.
عادة عند انتشار فيروس معين بالجو تعد اشجار الفواكه و الخضراوات الأكثر عرضة للإصابة بسوء الفيروس و لذلك يتم فحص النباتات للكشف عن وجود فيروسات فيها و ذلك باجراء فحوصات في مختبر الأحياء الدقيقة ومختبر البيولوجيا الجزيئية.
قد تجرى فحوصات ميكروبيولوجية على الألبان و الحليب و ذلك بأخذ عينات منها و زراعتها على بيئة الآغار و مراقبة نمو البكتيريا تحت ظروف مناسبة مثل درجة حرارة ودرجة حموضة مناسبتين.