لا يُمكن القول بأنّ هنالك علاج أفضل من الآخر لعلاج جرثمونة المعدة الناجمعة عن الإصابة بعدوى بكتيريا H. pylori، فتعتمد الخيارات المتاحة على حالة المصاب، وبعض العوامل الأخرى التي يُحددها الطبيب، وإما يكون العلاج الممتبع بإعطاء المُصاب:
**العلاج الثلاثي (ثلاثة أدوية):
*الأموكسيسلين (بالإنجليزية: Amoxicillin) أو ميترونيدازول (بالإنجليزية: Metronidazole).
*الكلاريثروميسين (بالإنجليزية: Clarithromycin).
*مثبطات مضخة البروتون (بالإنجليزية: protein pump inhibitors) مثل أوميبرازول (بالإنجليزية: omeprazole) أو لانسوبرازول (بالإنجليزية: lanzoprasole).
**العلاج الرباعي (أربعة أدوية):
*مثبطات مضخة البروتون
*ميترونيدازول
*التتراسيكلين (بالإنجليزية: Tetracyclin)
*البَزْموت (بالإنجليزية: Bismuth).