مهام الصيدلة السريرية في المستشفيات هي متابعة حالة المريض كاملة بحيث يتم التأكد من أن المريض يتناول الجرعات الصحيحة في الأوقات الصحيحة ويتم التأكد من أن المريض يتناول جميع الأدوية الللازمة لعلاج الأمراض التي يعاني منها والأدوية اللازمة للتخفيف من الأعراض التي أتى بها إلى المستشفى، كما أن الصيدلاني السريري يعمل على إعطاء توصيات في حال وجود تعارض في هذه الأدوية، أو في حال كان المريض بحاجة لعلاج من الآثار الجانبية لبعض الأدوية.
وفي النهاية على الصيدلاني السريري عمل شرح كامل للمريض عن طبيعة مرضه وأدويتة وكيفية تناولها والتحذير من الممارسات أو الأطعمة التي قد تؤثر على المرض الذي يعاني منه والأدوية التي يتناولها.