بعض الأدوية لها آثار جانبية تؤثر على الجهاز الهضمي وتسبب الإسهال، وبعضها تعمل على مقاومة البكتيريا والفطريات فتسبب الإسهال للتخلص منها.
ويعتبر الإسهال من أكثر الآثار الجانبية التي تصيب المريض نتيجة تناول الأدوية المعالجة لحموضة المعدة،
وفي حال كان الإسهال عبارة عن سوائل فلا يسبب أي مشكلة أما عندما يكون يحتوي على مخاط ولونه غير طبيعي فيجب مراجعة الطبيب.