هناك الكثير من الاقسام الموجودة في مركز الحسين للسرطان منها
1 قسم الكشف المبكر ويشمل عدة اطباء وكوادر طبية مختلفة من اجل الكشف المبكر عن عدة انواع من السرطان
2 قسم الجراحة ويتكون من عدة اطباء من مختلف التخصصات اضافة الي كوادر طبية مختلفة من اجل استئصال اي ورم يمكن ازالته من خلال الجراحة
3 قسم الاشعة التشخيصية ويحتوي علي كافة الاجهزة اللازمة لتصوير جميع انحاء الجسم من اجل تشخيص الاصابة بالسرطان وتحديد مرحلة السرطان
4 قسم الاشعة العلاجية ويحتوي علي كافة الاجهزة الشعاعية اللازمة لعلاج مريض السرطان ولكافة انواع الحالات
5 قسم العلاج الكيماوي حيث يتم تقديم كافة انواع العلاجات الكيماوية ولكافة الاعمار والحالات
6 قسم المختبرات التشخيصية ويشتمل علي كافة فحوصات الدم والبول والانسجة اللازمة لتشخيص مرض السرطان
7 قسم العناية الحثيثة
8 قسم العناية التلطيفية وعلاج الالم
9 قسم زراعة نخاع العظم
وعلي اية حال فهناك اقسام اخري تابعة للمركز يطول ذكرها