تشخص الأمراض الباطنية من قبل الطبيب المختص باتباع ما يأتي :
*سؤال الشخص عن الأعراض التي يعاني منها .
*التشخيص السريري و ذلك بوضع يده على بطن المريض و الضغط على المناطق المختلفة لمعرفة مكان الألم و وجود أي انتفاخ أو كتل .
*تحليل الدم المخبري .
*تحليل البراز .
*التظير العلوي أو السفلي بإدخال شريط رفيع معه كاميرا صغيرة موصولة مع شاشة لمشاعدة ما داخل الجسم .
*إجراء الصور التشخيصية ، مثل الأشعة السينية ، الطبقية و غيرها .