يتم اجراء فحص زراعة البول عند شعور المريض بأعراض التهابات في المسالك البولية مثل ظهور الدم بالبول أو تغير البول للون الأحمر أو البني والشعور بحرقة اثناء التبول، والشعور بألم في المثانة والبطن و أسفل الظهر، والحرقة والجكة الشديدة عند التبول، والرغبة الشديدة بالتبول وغيرها، فيطلب الطبيب فحصاً للبول.
يتم فحص البول باستخدام الميكروسكوب فإن ظهور البكتيريا أو كريات الدم البيضاء بالبول بكميات كبيرة يعتبر سبباً لحدوث المسالك البولية وعليه يقوم فني المختبر باجراء فحص زراعة لعينة البول على نوعين معينين من بيئة الآغار ومتابعة نمو البكتيريا في بيئة الزراعة وذلك بهدف تحديد نوع البكتيريا المسببة لالتهاب المسالك وتحديد المضاد الحيوي المناسب لقتل هذه البكتيريا.
ومن الممكن أن يطلب الطبيب فحصاً لزراعة البول عند وجود حالة من التهاب الكلى المتكرر عند المريض أو عند ملاحظة وجود كريات دم و بكتيريا بكميات كبيرة في عينة السائل المنوي عند الرجال، فيتم فحص البول زراعياً للتأكد من عدم حدوث عدوى.
تنتشر حالات التهاب المسالك البولية عند النساء اكثر من الرجال ولذلك قد يقوم الطبيب بطلب اجراء فحص زراعة بول للمرأة عند وجود التهاب بكتيري بالمهبل أو الرحم خوفاً من انتشار العدوى للمثانة البولية.
و تتراوح نسبة اصابة المرأة الحامل بالتهاب المسالك البولية من 60-80% ولذلك يجب على المرأة الحامل اجراء فحص بول دوري خلال فترة الحمل.