يشك الطبيب بدايةً بالإصابة بالتهاب المسالك البولية من خلال الأعراض التي يأتي بها المصاب و أهم عرَض هو الشعور بألم عند الخواصر و يتمتد باتجاه الأفخاد أو ألم أسفل البطن إضافة إلى ارتفاع الحرارة ، تغير لون البول ، و الشعور بحرقة عند التبول .
يطلب الطبيب إجراء فحص دم للمصاب و يلاحظ ارتفاع كريات الدم البيضاء دلالة على وجود عدوى .
يطلب الطبيب بعدها إجراء تحليل و زراعة للبول لجزم التشخيص و تحديد نوع البكتيريا لاستخدام المضاد الحيوي المناسب لها و التأكد من عدم وجود مقاومة من قبل البكتيريا للمضاد الحيوي .
تحتاج نتائج الزراعة يومين لثلاثة أيام للظهور ، يصف الطبيب خلال هذه الفترة مضاد حيوي واسع التأثير بشكل مؤقت لحين ظهور النتيجة لمنع تفاقم الحالة .