من أهم أنواع البكتيريا التي تستهدف مهاجمة الجهاز البولي و تسبب التهاب المسالك البوليّة، بكتيريا سالبيّة صبغة الجرام في أغلب الحالات، ومنها:.
- بكتيريا E. coli، تسبب 50% من نسبة الاصابة بالتهابات المسالك البولية.
- بكتيريا الكليبسيلّا (Klebsiella).
- بكتيريا Proteus .
- بكتيريا الإنتيروباكتر (Enterobacter).
- البكتيريا الخضراء المزرقّة (Pseudomonas).
- بكتيريا الساريشيا، تسبب نسبة 40% من التهابات المسالك البوليّة (Serratia).
و من أنواع البكتيريا ايجابيّة صبغة الجرام:
- E. faecalis.
- S. saprophyticus.
- Staphylococcus aureus العنقوديّة الذّهبيّة.