هناك لكل مطبخ توابل خاصة تميزه عن المطابخ الأخرى فالمطبخ الأندونيسي يتميز بمجموعة من البهارات التي يكثر استعمالها ومنها :
جوزة الطيب , الكاري , والكولجان , القرنفل , هذه يكثر استخدامها بالنسبة للمطبخ الأندونيسي عن المطابخ الأخرى فلا تكاد نوع من الأطعمة تخلو منها .
ومن المعروف أيضاً تأثر المطبخ الأندونيسي متأثر بشكل كبير بالمطبخ الهندي و الماليزي والصيني .