تنتمي أشهر الأمراض الباطنية إلى أمراض الجهاز الهضمي و من الأمثلة على أمراض الجهاز الهضمي ارتداد المريء، الحموضة، القولون العصبي، الرداب القولوني (بالإنجليزية: Diverticulitis)، الإمساك، القرحة سواء كانت بالمريء أو المعدة أو الإثني عشر، أمراض الأمعاء الالتهابية (بالإنجليزية: inflammatory bowel disease) و يتضمن داء كرون و التهاب القولون التقرحي، يجب الإشارة إلى أنه يوجد عدد كبير من الأمراض الباطنية يعتمد الطبيب في تشخيصها على الأعراض والعلامات والتشخيص السريري كما يمكن أن يلجأ لعدة إجراءات كالتنظير والصور بأنواعها.