في الغالب يكون السبب وراء الإصابة بالأكياس المخاطية الفموية ، هو إصابة تحدث لأنسجة الفم تؤدي إلى تلفها، وتتضمن الأسباب الأخرى مايلي:
- عض الشفاه أو انسجة الفم الداخلية بشكل متكرر ومستمر
- نمو غير طبيعي للأسنان
- حدوث انسداد في الغدد اللعابية التي تقع تحت اللسان في الفم.
علما أن الأكياس المخاطية الفموية هي أكياس رقيقة تحتوي على سائل، ذو ملمس ناعم ولون وردي، وغالبا يكون حجمها 8 ملليليتر تقريبا وقد تسبب ألم وانزعاج.