لوث المياه يسبب أضرار كثيرة للإنسان والحيوان والنبات متل:
- ثلوث المياه الشرب من إحدى مسببات الأمراض للإنسان مثل: داء الجيارديا والذي يسبب القيئ المستمر والغثيان الشديد ويأتي هذا المرض عادة من الماء الغير معالجة والتي تتلوث من فضلات الحيوانات.
ويزيد أعداد المصابين بهذا المرض في الدول النامية.
- ثلوث الماء يؤثر على النظام البيئي والسلسلة الغذائية للكائنات الحية من تأثيرها بمواد عدّة مثل مادة الكادميوم التي تكون في الماء الملوث، ومادة الرصاص، فتأكل المحار والأسماك الكبيرة الأسماك الصغيرة التي تكون تتغذى من تلك المواد وتستمر السلسلة الغذائية بمستوياتها ويتنقل الامراض التي -تكون من المواد الملوثة-من كائن إلى أخر. وبالتالي نفقد جزء كبير منهم. أي موت الحيوانات المائية وبالتالي تحدث أضرار وتقتل الكائنات الحية التي تعيش في الماء حيث تسبب في موت الأسماك والطيور مثل " نوارس البحر " والدلافين ..
اذا كان التلوث كيمائي فيكون أسبابه الأنسان الذي يتخلص من القمامة في البحار فتنج مواد كيمائية تضر المياه وتضر الثروة السمكية وتنتقل إلي السلسلة كاملة .