يتم علاج التهاب الاحليل من خلال المضاد الحيوي عندما يكون الالتهاب ناتج عن عدوى بكتيرية و قد يصف الطبيب اكثر من مضاد حيوي في حال عدم معرفة سبب العدوى
و اذا كان الالتهاب ناتج عن عدوى جنسية فيتم علاج الطرفين بالمضاد الحيوي حتى يمنع تكرار الالتهاب
و منع الاتصال الجنسي حتى الشفاء
كذلك يجب شرب الكثير من الماء