بكتيريا الأمعاء نوع من أنواع الكائنات الحية المهمة لإكمال وظائف الأمعاء، لكن تكاثرها بشكل غير طبيعي يمكن أن يؤدي إلى مشاكل صحية على الجهاز الهضمي وجسم الانسان , و في حال وجود أي كسل أو مكوث بكتيري لمدة طويلة داخل الأمعاء يسبب تكاثرها وتزايدها والبكتيريا لا ترى بالعين المجردة لا من خلال عمل خص براز يمكن من الكشف عنها . هناك بعض انواع الاعشاب التي تساعد على علاج التهاب الامعاء الدقيقة منها :
البابونج من أقوى المضادات المعالجة لكافة الالتهابات في الجهاز الهضمي عامة والأمعاء خاصة و النعناع: يعتبر النعناع من أفضل الأعشاب المساعدة في عملية الهضم ومعالجة الالتهابات. الريحان: من افضل الأعشاب التي تستخدم لتطهير الأمعاء.