يعمل الفينتانيل على تثبيط عمل الجهاز العصبي المركزي ويسبب عدم وصول الإشرات العصبية من الدماغ إلى جميع أجزاء الجسم، مما يعمل على تخدير الجسم وعدم شعور المريض بالألم وبالتالي تسير العملية الجراحية بسهولة ودون تحرك المريض، وقد يسبب تناول الفينتانيل إلى شعور المريض بالبرد والقشعريرة وصعوبة في التنفس وقد يتسبب ببعض الإضطرابات الهضمية.