هناك مئات الانزيمات الموجودة في الدماغ ولكن هناك انزيمان شهيران في هذا المجال
1 BACE1 وهو انزيم موجود في السائل الدماغي csf ويعتبر ارتفاعه مؤشرا علي وجود مرض الزهايمر اذ ان زيادة نشاط هذا الانزيم تؤدي الي تراكم مادة الامايلويد في انسجة الدماغ وهناك ابحاث كثيرة الان من اجل كبح نشاط هذا الانزيم من اجل علاج مرضي الزهايمر
2 CK-BB وهو انزيم موجود في انسجة الدماغ ويساعد علي تشخيص بعض اورام الدماغ او السحايا او الضربات علي الراس مثلا كما وجد ان هذا الانزيم موجود في دماء الاشخاص الذين يعانون من هشاشة العظام ايضا ويمكن البحث عن هذا الانزيم اما في الدم او السائل الدماغي csf وذلك من خلال عملية الترحيل الكهربائي للانزيم CPK وذلك بعملية تدعي Isoenzyme electrophoresis داخل المختبر