عند التزام الطبيب و المريض بالطريقة المثلى لتقويم الاسنان و التزام المريض بأرشادات و تعليمات الطبيب في الغالب لا تكون هنالك مضار للتقويم ،و بالتالي تنشأ المضار من الاهمال المريض للزيارات الدورية عند طبيب الاسنان و اهمال المريض للعناية السنية في فترة علاج التقويم ، المضار تكون بشكل تسوس للاسنان و في بعض الحالات تكون بشكل وجود بقع بالاسنان على الوان ما بين اللون الابيض و اللون البني مما يكون سبب نقص المعادن في سطح السن و تكون البداية للتسوسات و قد يصاحب ايضاً علاج التقويم في حال كان التقويم بشكل سريع و مبالغ فيه بعض المشاكل كذوبان الجذور و التهاب العظم و الالتهابات اللثوية و موت العصب .