في الغالب لا تحدث الالتهابات الفطرية في المسالك البولية الا في حالات خاصة كالمرضى ذوي المناعة القليلة كالذين يتلقون بعض العلاجات المناعية، او الكورتيزون ،
وتحدث ايضا هذه الالتهابات نتيجة لوضع قسطر البول .
العلاج : الامفوتيراسين بي حيث يتم غسل المثانة البولية لمدة 7 ايام.
او بواسطة الوريد.
ودواء الفلوكينازول flucenazole بواسطة الفم لمدة 4-7 ايام.