بما أن داء البول القيقبي (بالإنجليزية: Maple Syrup Urine Disease) هو مرض وراثي لذا فإنه لا يوجد أي طريقة لمنع الإصابة به.
يمكن أن يساعد مستشار الأمراض الوراثية في تحديد خطر ولادةِ طفلٍ مصابٍ به كما تساعد الفحوصات الجينية في الكشف فيما إذا كان أحد الوالدين حاملاً للمرض.
ويمكن استخدام فحص الحمض النووي للكشف عن إصابة الطفل بالمرض قبل ولادته.