هناك عدة هرمونات تفرز في الكلي ومن هذه الهرمونات فيتامين د النشط( Calciferol) حيث ان هذا الهرمون له علاقة بجهاز المناعة وطريقة عمله حيث ربطت الكثير من الدراسات بين هذا الهرمون والكثير من الامراض مثل السرطان وهشاشة العظام حيث ثبتت فعالية هذا الهرمون في تقليل الالتهابات كل ذلك من ناحية ومن ناحية اخري فقد اثبتت الدراسات وجود علاقة بين الفشل الكلوي المزمن وحدوث الالتهابات المتكررة او ظهور بعض انواع الاورام حيث ان الهرمونات الجنسية لها مستقبلات علي سطح الخلايا المناعية هذا ومن الجدير بالذكر ان الكلي لها تاثير علي مستوي الهرمونات الجنسية في الجسم من خلال التاثير علي المهاد التحتاني حيث اثبتت الدراسات وجود اضطرابات في الدورة الشهرية او انقطاع لها عند النساء في حالة الفشل الكلوي المزمن ولكن الاليات التفصيلية لذلك ليست واضحة بشكل كامل